首都醫科大學建校于1960年，是北京市重點高等院校，是北京市政府、國家衛生健康委員會、教育部共建院校。已故著名泌尿外科專家、兩院院士、全國人大常委會副委員長吳階平教授為首任校長。現任黨委書記為呼文亮研究員，校長為神經病學專家、中國工程院院士吉訓明教授。

學校校本部設有11個學院、1個研究中心，包括基礎醫學院、藥學院、公共衛生學院、護理學院、生物醫學工程學院、中醫藥學院、醫學人文學院、全科醫學與繼續教育學院、馬克思主義學院、國際學院、燕京醫學院，腦重大疾病研究中心。學校現有23所臨床醫學院（其中21所為附屬醫院），包括首都醫科大學宣武醫院（第一臨床醫學院）、附屬北京友誼醫院（第二臨床醫學院）、附屬北京朝陽醫院（第三臨床醫學院）、附屬北京同仁醫院（第四臨床醫學院）、附屬北京天壇醫院（第五臨床醫學院）、附屬北京安貞醫院（第六臨床醫學院）、附屬北京積水潭醫院（第七臨床醫學院）、附屬復興醫院（第八臨床醫學院）、附屬北京佑安醫院（第九臨床醫學院）、附屬北京胸科醫院（第十臨床醫學院）、首都醫科大學三博腦科醫院（第十一臨床醫學院）、附屬北京地壇醫院（第十二臨床醫學院）、附屬北京兒童醫院（兒科醫學院）、附屬首都兒童醫學中心（第二兒科醫學院）、附屬北京口腔醫院（口腔醫學院）、附屬北京安定醫院（精神衛生學院）、附屬北京婦產醫院（婦產醫學院）、附屬北京中醫醫院（中醫藥臨床醫學院）、附屬北京世紀壇醫院（腫瘤醫學院）、附屬北京康復醫院（北京康復醫學院）、附屬北京潞河醫院（潞河臨床醫學院）、中國康復研究中心（康復醫學院）、中日友好醫院（中日友好臨床醫學院），以及預防醫學教學基地（北京市疾病預防控制中心）。學校還設有41個臨床專科學院、專科學系，40個臨床診療與研究中心。

學校現有全日制在校生16094人，其中研究生7948人，本科生7485人，高專高職生255人，留學生406人；成教生2103人。學校和附屬醫院現有教師8394人,其中有院士7人；教授1210人，副教授2022人；博士生導師1509人，碩士生導師1880人。

學校現有8個國家重點學科，2個國家重點（培育）學科；93個國家臨床重點專科（含中醫）；14個國家中醫藥管理局重點（培育）學科；4個北京市一級重點學科，6個北京市二級重點學科，1個北京市重點交叉學科，1個北京地區高等學校學科群。學校臨床醫學、藥理學和毒理學、神經科學與行為學、免疫學、生物學與生物化學、分子生物學與遺傳學、社會科學總論、精神病學與心理學、微生物學、環境與生態學、化學、材料科學、農業科學、工程學、綜合交叉學科15個學科進入ESI學科全球前1%排名，其中，臨床醫學、藥理學與毒理學、神經科學與行為學進入ESI學科前1‰，免疫學、生物學與生物化學、分子生物學與遺傳學進入ESI學科前3‰、社會科學總論、精神病學與心理學、微生物學進入全球前5‰。

有8個一級學科博士學位授權點和13個一級學科碩士學位授權點；按照二級、三級學科統計，有59個博士學位授權點和77個碩士學位授權點；具有所有醫學及醫學相關學科的碩士、博士專業學位授予權。有9個博士后科研流動站。學校設置的長學制專業有臨床醫學、兒科學和口腔醫學；本科專業有臨床醫學、基礎醫學、口腔醫學、兒科學、預防醫學、精神醫學、藥學、臨床藥學、中醫學、中藥學、護理學、生物醫學工程、假肢矯形工程、智能醫學工程、康復治療學、康復物理治療、康復作業治療、聽力與言語康復學、公共事業管理（衛生管理）、法學（衛生法學）、醫學實驗技術、醫學檢驗技術、醫學影像技術、信息管理與信息系統（衛生信息管理）、眼視光醫學、衛生檢驗與檢疫、助產學27個；高職（專科）教育設有臨床醫學、護理2個專業。學校培養醫學與醫學相關學科的學術型和應用型人才，形成了全方位、多層次、創新型人才培養模式。

學校目前有教育部、國家衛生健康委員會“卓越醫生教育培養計劃”試點項目6個；7個國家級和10個市級特色專業；4個北京市重點建設一流專業、13個國家級和11個市級一流本科專業建設點；5門國家級精品資源共享課程、7門國家級和18門市級精品課程、17門國家級一流本科課程和25門北京高校優質本科課程；2門國家級課程思政示范課程，8門北京市高校課程思政示范課程。3個國家級和6個市級實驗教學示范中心，3個國家級人才培養模式創新實驗區和1個市級人才培養模式創新試驗區、5個北京市級校外人才培養基地和1個素質教育基地。7個國家級優秀教學團隊、2個黃大年式教師團隊，2個教育部課程思政示范課教學團隊，11個市級優秀教學團隊、5個北京高校優秀本科育人團隊、8個北京市高校課程思政示范課團隊。1名國家級教學名師、33名市級教學名師、5名青年教學名師、3名“高創計劃”教學名師。學校共獲得教育教學成果獎國家級特等獎1項、二等獎9項、優秀獎1項，市級特等獎2項、一等獎25項、二等獎40項、優秀獎1項。學校2023年在教育部本科教學工作審核評估中獲得專家組充分肯定，2024年高質量通過了教育部臨床醫學專業認證。

學校有7個國家醫學中心、6個國家臨床醫學研究中心；2個省部共建協同創新中心；2個全國重點實驗室、1個省部共建國家重點實驗室培育基地、5個教育部重點實驗室、1個工信部實驗室、1個國家藥監局實驗室、3個北京實驗室、17個北京市重點實驗室；2個國家工程研究中心、1個國家工程技術研究中心、3個教育部工程研究中心、6個北京市工程研究中心、10個北京市工程技術研究中心；有3個教育部創新團隊，3個科技部重點領域優秀創新團隊。在擁有一批國家級和市級重點學科和重點實驗室的同時，學校建有高水平的國家級、市級研究和培訓機構，如國家生命科學與技術人才培養基地、原衛生部全科醫學培訓中心、北京市全科醫學培訓中心、首都醫科大學國家醫療保障研究院、首都醫科大學健康醫療大數據國家研究院、首都衛生管理與政策研究基地等。近5年來，學校承擔了國家重點研發計劃、國家科技重大專項、國家自然科學基金、國家社會科學基金、北京市科委以及北京市自然基金等科研項目3909項（其中國家級科研項目2321項），累計科研經費44.66億元。獲得各類各級獎勵139項，其中國家科技進步獎5項（含合報）、北京市科技獎29項、教育部高等學校科學研究優秀成果獎9項、中華醫學科技獎31項、吳階平系列醫學藥學獎2項、茅以升北京青年科技獎3項、吳階平-保羅·楊森獎3項、何梁何利科技獎3項、全國創新爭先獎2項、中源協和生命醫學獎1項、華夏醫學科技獎50項；哲學社會科學優秀成果獎1項。獲得專利授權8574項。

學校建有圖書館、檔案館、校史館、中心實驗室、實驗動物部、學報編輯部、校醫院等公共服務平臺。

學校先后與美國、加拿大、澳大利亞、英國、瑞典、挪威、香港、臺灣等20個國家和地區的50多所高校和相關單位簽訂了友好交流合作協議。先后接待50多個國家和地區的專家學者和學生數百人來校進行學術交流訪問。學校獲批首批北京市“一帶一路”國家人才培養基地，是國家留學基金委創新型國際人才培養項目院校。留學生涵蓋了本科、碩士、博士研究生及進修生。除交流訪問外，學校還通過線上線下多種渠道，選派師生參加有關學習項目和學術會議。

學校始終堅持社會主義辦學方向，全面貫徹黨的教育方針，堅持以立德樹人為根本，秉承“扶傷濟世、敬德修業”的校訓，遵循醫學教育規律，牢記社會責任，把為健康中國健康北京建設、京津冀協同發展戰略實施、首都“四個中心”功能建設做貢獻為己任，努力辦人民滿意的醫科大學，培養人民滿意的健康守護人，做出能更好服務人民對健康美好需求的科研成果。站在新的歷史起點上，全體首醫人將貫徹新發展理念，聚焦高質量發展，進一步求真務實、凝心聚力、積極進取、追求卓越，全面提升學校核心競爭力，努力將學校建設成為國際一流的研究型醫科大學。

(2025年4月更新)